沙門氏菌歸屬于沙門氏菌屬（Salmonella），是一大群寄生于人類和動物腸道內，在形態結構、培養特性、生化特性和抗原構造等方面極為相似的革蘭氏陰性桿菌。
有的專對人類致病，有的只對動物致病，也有對人和動物都致病，目前發現的沙門氏菌血清學有2500多種，其中1400種能感染人類，這些統稱為沙門氏菌。
由于Salmon發現本屬細菌的時間較早，在研究中的貢獻較大，遂定名為沙門氏菌屬，它是引起人類食物中毒最常見的病菌之一。
雖然沙門菌屬(Salmonella)包含很多類型，臨床上一般分兩大類：
導致傷寒或腸熱癥的沙門菌——即由傷寒沙門菌和副傷寒沙門菌引起的，而且僅對人類有致病性。
其他血清型沙門菌屬統稱為非傷寒沙門菌，主要導致胃腸炎。
而引起暴發流行的常常是非傷寒沙門氏菌，一般我們如果沒有特指的話，所說的沙門氏菌多指非傷寒沙門氏菌。
對于兒童常見的也是非傷寒沙門菌。而且沙門氏菌最易感染群也是兒童。
沙門氏菌主要造成兩種明顯的疾病：
其一，由非傷寒沙門氏菌引起的胃腸炎或“食物中毒”癥狀。一般我們如果沒有特指的情況下，常說的沙門氏菌就是這一類型。
其特征是發燒、惡心、嘔吐、腹部絞痛、腹瀉、頭痛和寒戰。癥狀可能輕微到嚴重，大多數患者臨床表現輕中度癥狀，甚至無癥狀。
通常在感染后24～48小時(范圍在8~72小時）出現發熱、頭痛、腹部痛性痙攣和腹瀉等癥狀。
患者多為稀水樣大便，量中等，重癥可出現膿血便。疾病的嚴重程度和癥狀出現的時間與感染細菌量(感染劑量)有關。
腹瀉常為自限性，持續3~7天。如果腹瀉持續10天以上或發熱持續超過72小時，要注意考慮其他原因可能。
腸胃炎合并非傷寒沙門菌菌血癥發病率低于5％，通常為自限性。菌血癥并發癥包括心內膜炎、霉菌性動脈瘤、骨髓炎等。
如果確診患者持續發熱超過72小時，或者出現寒戰或僵直等全身癥狀，應考慮并發癥的可能。
其二，傷寒和副傷寒腸道沙門氏菌引起傷寒癥（或稱 腸熱病）。這一類型臨床上比較少見，在一些傷寒疫區需要考慮。
腸熱病臨床表現為發熱和腹部癥狀，潛伏期通常為10~14天(范圍3～21天)。腸熱病患者的臨床表現多種多樣，對曾到流行區旅行的發熱患者應考慮此病。
通常發熱前會存在一些列的前驅癥狀 如寒冷、出汗、全身不適、頭痛、干咳、肌痛、關節痛等；
然后出現進行性發熱，多數呈39-40℃的高熱，并逐漸升高，如果不治療，發燒甚至能持續數個星期，然而，用抗微生物藥治療，患者在 10-14 天內康復。
約20％患者皮膚出現散在淡紅色斑丘疹(玫瑰疹)，淺膚色皮膚易見；
肝臟常可受損，肝功能異常，尤其是膽紅素和轉氨酶水平升高，還可以見皮膚黃疸；
腹部癥狀包括腹痛較為常見，便秘比腹瀉常見；
嚴重并發癥包括出血和穿孔。
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